Podlaska Agencja Zarządzania Energią została utworzona w czerwcu 2003 roku. Agencja jest afiliowana przy Podlaskiej Fundacji Rozwoju Regionalnego i posiada własny statut, Radę Agencji oraz Komitet Techniczny. Nadzór nad Agencją jest sprawowany przez niezależną Radę Agencji w skład której wchodzą przedstawiciele Samorządu Województwa Podlaskiego, Podlaskiej Fundacji Rozwoju Regionalnego, Podlaskiego Euro Info Centre oraz przedstawiciele organizacji przedsiębiorców, firm energetycznych i Krajowej Agencji Poszanowania Energii.

Główną rolą Komitetu Technicznego jest wsparcie doradcze i eksperckie w stosunku do inicjatyw podejmowanych przez Agencję. Agencja będzie podejmowała działania w oparciu o zasadę „non profit”, co jest w pełni zgodne ze statutem Podlaskiej Fundacji Rozwoju Regionalnego.

W grudniu 2004r. została uruchomiona strona internetowa www.paze.pl poświęcona odnawialnym źródłom energii oraz termooszczędności.